Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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