Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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