Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC02021-203ENST00000514145 569 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PSG5-201ENST00000342951 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms