Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EIF4EBP1Q13541 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms