Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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