Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CEP41-217ENST00000541543 6222 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms