Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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