Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms