Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAPPC6BQ86SZ2 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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