Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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