Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms