Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYN1P17600 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYN1P17600 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms