Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RBMY2YP-201ENST00000423333 912 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02474-202ENST00000441160 1148 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC026415.1-201ENST00000505404 471 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 602.3 ms