Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms