Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms