Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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