Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CDC25C-203ENST00000415130 1556 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL3P4-201ENST00000417615 423 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RIT2-202ENST00000589109 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC114786.2-201ENST00000510090 1426 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms