Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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