Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms