Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD12P35452 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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HOXD12P35452 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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HOXD12P35452 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD12P35452 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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