Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MARK2P14-201ENST00000449657 628 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAXDC2-206ENST00000518651 536 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC010538.1-201ENST00000615131 663 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C20orf78-202ENST00000623418 606 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC018682.1-201ENST00000506009 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms