Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDK4Q16654 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms