Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG5Q9UPR3 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms