Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms