Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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