Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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