Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms