Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms