Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMM50Q9Y512 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMM50Q9Y512 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms