Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SH3BP1Q9Y3L3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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