Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms