Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZNF608Q9ULD9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF608Q9ULD9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms