Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms