Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms