Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms