Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms