Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms