Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCMF1Q9P0J7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCMF1Q9P0J7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms