Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARHGEF12Q9NZN5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms