Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2L1Q9NZI6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms