Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA4L2Q9NRX3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms