Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms