Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms