Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRDE2Q9H7Z3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms