Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNCQ9H7C4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms