Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms