Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZYG11BQ9C0D3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms