Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms