Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL3Q9BXA9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms