Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms